In This Package:

Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:

- _ -

• __init__() : SiteConfig::SiteConfigPdsfSim, SiteConfig::SiteConfigPdsfTest, SiteConfig::SiteConfigPdsf, SiteConfig::SiteConfigLocal, SiteConfig::SiteConfig, Manager::Manager, JobState::JobState, JobConfig::JobConfig, FileDescription::FileDescription

- a -

• addSequenceStats() : Manager::Manager
• ADDSTATS : JobState::JobType

- b -

• batchCommand() : SiteConfig::SiteConfigPdsfSim, SiteConfig::SiteConfigPdsfTest, SiteConfig::SiteConfigPdsf, SiteConfig::SiteConfigLocal, SiteConfig::SiteConfig
• batchLogDirectory() : SiteConfig::SiteConfig
• batchLogErrFile() : SiteConfig::SiteConfig
• batchLogOutFile() : SiteConfig::SiteConfig

- c -

• clear() : FileDescription::FileDescription
• clearSequence() : Manager::Manager
• clearSequenceStats() : Manager::Manager
• clearSummary() : Manager::Manager

- e -

• ensureDirectories() : Manager::Manager

- f -

• figuresDirectory() : SiteConfig::SiteConfig
• figuresPathReplace() : SiteConfig::SiteConfig

- g -

• generateFigures() : Manager::Manager
• getName() : JobState::State
• getState() : Manager::Manager
• getStateByName() : JobState::State
• getStateFromFile() : Manager::Manager

- i -

• initializeOptions() : Manager::Manager
• isLocked() : Manager::Manager

- j -

• jobId() : SiteConfig::SiteConfig

- l -

• lastLine() : Manager::Manager
• lockRun() : Manager::Manager
• lockRunIndex() : Manager::Manager
• lockStats() : Manager::Manager
• logDirectory() : SiteConfig::SiteConfig
• logErrFile() : SiteConfig::SiteConfig
• logOutFile() : SiteConfig::SiteConfig

- m -

• makeJobCommand() : Manager::Manager

- p -

• parseOptions() : Manager::Manager
• printState() : Manager::Manager
• processSequence() : Manager::Manager

- r -

• removeLock() : Manager::Manager
• resolveRunSequenceFile() : Manager::Manager
• run() : Manager::Manager
• RUN : JobState::JobType
• RUN_DONE : JobState::State
• RUN_FAILED : JobState::State
• RUN_PROCESSING : JobState::State
• RUN_READY : JobState::State
• runBatch() : Manager::Manager
• runCommand() : Manager::Manager
• runIndexDir() : SiteConfig::SiteConfig
• runIndexFile() : SiteConfig::SiteConfig
• runIndexLocked() : Manager::Manager
• runIndexLockFile() : SiteConfig::SiteConfig
• runLocked() : Manager::Manager
• runLockFile() : SiteConfig::SiteConfig
• runOneJob() : Manager::Manager
• runSepDir() : SiteConfig::SiteConfig
• runSubDir() : SiteConfig::SiteConfig

- s -

• sequencesInRun() : Manager::Manager
• set() : FileDescription::FileDescription
• setByFileName() : FileDescription::FileDescription
• setLock() : Manager::Manager
• setState() : Manager::Manager
• setStateInFile() : Manager::Manager
• stateFile() : SiteConfig::SiteConfig
• STATS_ADDING : JobState::State
• STATS_DONE : JobState::State
• STATS_FAILED : JobState::State
• STATS_READY : JobState::State
• STATS_UNKNOWN : JobState::State
• statsDirectory() : SiteConfig::SiteConfig
• statsInstallPath() : SiteConfig::SiteConfig
• statsLocked() : Manager::Manager
• statsLockFile() : SiteConfig::SiteConfig
• statsRelativeDir() : SiteConfig::SiteConfig
• statsSeqFile() : SiteConfig::SiteConfig
• statsSumFile() : SiteConfig::SiteConfig
• SUMMARY : JobState::JobType
• SUMMARY_ADDING : JobState::State
• SUMMARY_DONE : JobState::State
• SUMMARY_FAILED_ADDING : JobState::State
• SUMMARY_FAILED_INDEXING : JobState::State
• SUMMARY_FAILED_PRINTING : JobState::State
• SUMMARY_INDEXED : JobState::State
• SUMMARY_INDEXING : JobState::State
• SUMMARY_PRINTED : JobState::State
• SUMMARY_PRINTING : JobState::State
• SUMMARY_READY : JobState::State
• SUMMARY_UNKNOWN : JobState::State

- u -

• UNKNOWN : JobState::State
• unlockRun() : Manager::Manager
• unlockRunIndex() : Manager::Manager
• unlockStats() : Manager::Manager
• updateFullIndex() : Manager::Manager
• updateRunIndex() : Manager::Manager

- x -

• xmlDirectory() : SiteConfig::SiteConfig
• xmlIndexFile() : SiteConfig::SiteConfig
• xmlRelativeDir() : SiteConfig::SiteConfig

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